琉璃成为新舰长后，昔日最信任的战友化身“暗黑王子”，驾驶黑色战舰前来复仇。
剧场版设定在TV版三年后。19岁的星野琉璃晋升为机动战舰抚子号B型舰长。在一次边境巡逻中，遭遇来历不明的黑色战舰“复仇者号”，其驾驶员竟是当年抚子号最优秀的机师、被认为战死的明人。他被敌军改造为拥有超强感知力的“暗黑王子”，脑内被植入“杀死琉璃”的指令。琉璃拒绝开火，用广播反复呼叫“明人先生”。最终决战，琉璃关闭战舰防御系统，独自出舱站在舰桥上。明人的机甲手停在琉璃面前十厘米处，系统过载自爆。明人跳伞被救回，但失去记忆。琉璃握着他的手说：“没关系，我们从头认识。”
机甲战斗作画至今仍是一流水准，情感虐心程度堪称系列之最。琉璃从少女到舰长的成长线令人心疼，最后出舱那幕是永恒的经典。
根据原始关联 ID 与同类内容生成的站内内链推荐
中国香港
▶
废柴青年在中秋夜对着月亮许愿，结果竟将月宫里的玉兔和吴刚“召唤”到了自己家。
中国大陆
▶
一场毁容事故后，她戴上丑陋面具接近仇人，却意外揭开了整座城市的虚伪面具。
中国香港
▶
金牌猎头被迫为黑帮寻找一个“替罪羊CEO”，在接触商业精英的过程中，她发现自己才是那个被猎的“头”。
美国
▶
被全家遗忘生日的10岁男孩，许愿“变成大人”，第二天他真的成了40岁的中年秃顶大叔。
中国香港
▶
一位失忆的声乐天才发现，自己唱出的旋律能还原凶案现场的最后三分钟。
澳大利亚
▶
七个年轻人用通灵板复活了车祸身亡的朋友，但他回来的只是一副会说话的人皮。
日本
▶
平凡高中生被突然告知是伊贺流第49代继承人，而他必须在一周内找到替身，否则就会被当作祭品。
日本
▶
全世界只剩最后一棵树和最后一个人类，他们用一生学会了对话。