怪医发明缩形射线，将病人缩至毫米级后进入大脑摘除病灶，但缩小的病人开始失踪。
天才外科医生黑岩发明了能将人体缩小至1毫米的射线，以微创形式进入患者脑部直接切除肿瘤。前三例手术大获成功，但第四位患者术后在培养皿中消失得无影无踪。黑岩发现，原来在缩小后，病人“意识体”会掉入脑皮层缝隙中的微观世界，那里存在着以缩小人体为食的“脑蛭”。为救回病人，黑岩将自己缩小，闯入自己大脑的幽暗丛林，开始一场惊心动魄的自我解剖。
想象力炸裂，视觉呈现宛如《盗梦空间》遇上《惊奇队长》的量子领域。对身体内部的窥探充满猎奇美感，结局细思极恐。
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